遭遇戰(Encounters)是在特定地點遭遇敵人時發生的戰鬥。在遊戲中若敵人碰觸到Kris，就會引發遭遇戰。由於敵人會出現在主世界地圖上，因此可以透過"奔跑"(預設[X])來躲避戰鬥。然而這不適用於任何特殊頭目。
戰鬥系統與Undertale或是其他RPG戰鬥模式類似，但是樣貌有很大的不同，最顯著的特徵是第一人稱戰鬥模式改成第三人稱戰鬥模式。
在戰鬥中會顯示幾個主要功能與選項，例如小隊各成員的名稱、圖示和當前HP，下方則是有類似Undertale中的"攻擊(FIGHT)"、"行動(ACT)"和"道具(ITEM)"選項(仁慈(MERCY)選項被寬恕(SPARE)選項所取代)，並加入了魔法(MAGIC)和防禦(DEFEND)等新功能。
彈幕面板[]
遊戲中的彈幕面板與白色擦彈判定
彈幕面板(Bullet Board)是在遭遇戰中、限制靈魂行動之綠色方塊的非官方名稱。彈幕面板會於敵人的回合出現，敵人的攻擊會穿過它來攻擊靈魂並使小隊失去HP，與複數的敵人戰鬥時，他們的攻擊會重疊在面板上。彈幕面板通常會維持固定的正方形。
面板在特殊頭目下的攻擊有不同的特性，像是：
- King的四次攻擊中，面板會被上下甩動、被鍊子拉扯或是在白色方塊內反彈。
- Jevil的最終混亂攻擊中，面板擴大成整個屏幕，遊戲窗口本身成為邊界。
- Queen的某些攻擊會將面板邊框通電並旋轉，有時也會將面板變成酒杯形狀。
- Berdly和Tasque Manager的某些攻擊中，面板會變成菱形。
- Spamton的"吸金大法"和Spamton NEO的"超級大人物射擊"中，面板會因為吸引而變成梯形。
Deltarune中的彈幕面板為綠色正方形；Undertale中的彈幕面板則為白色長方形。
小隊的回合[]
與Undertale不同，Deltarune的回合必須要選擇所有成員的選項，這意味著每個成員都可以執行自己該執行的事物，使得可以在同一回合內執行許多動作，甚至可以在第一回合內就快速地結束戰鬥。
Kris永遠是第一位選擇選項的成員。
畫面中會有旁白口吻的敘述文字出現：
- 遭遇戰開始時，通常會描述遭遇者的習性特質(例如：Rudinn Ranger們閃亮登場！)
- 第一回合後，通常會針對遭遇戰的其中一隻怪物作描述，敘述文字的變化取決於小隊上回使用的"行動"選項。
- 使用"行動"後，敘述文字也可能會描述小隊的狀態或故事元素。
攻擊(FIGHT)[]
雖然攻擊在這個世界是沒有必要的...
但基礎知識了解一下也不差！Ralsei
小隊需要選擇敵人來進行攻擊。每一個成員在每個回合內只能攻擊一次。又譯作「戰鬥」。
在第一章一開始的時候，Susie都會攻擊，並且不能選擇其他動作，直到乘坐卡片城堡的電梯從B1到達1F時，讓Susie"真正的"加入隊伍，這時才可選擇Susie的選項。
- 選擇戰鬥時會觸發快速反應事件，會有一個直桿滑過儀表，此時必須按「Z」攻擊。在白色長方形的標記按下「Z」可以造成最大的傷害。
- 直桿滑過儀表便會消失，攻擊也會失誤。成員的攻擊回合也會直接結束。
- 如果敵人的生命歸零時，它們會逃離戰鬥，因此在遊戲中無法獲得任何的EXP。但是在第二章中，以這種暴力方式擊敗敵人會增加隊伍的某些數值。
- 從第二章開始，如果使用攻擊擊敗了一定數量的敵人，則將被視為"失去(LOST)"。失去的敵人不能被招募，但隊伍會變得更加強大。
行動(ACT)[]
行動，善用它，就連最殘暴的敵人...
也能被我們善良的行動所打動！Ralsei
這個選項只有Kris才可使用。需要選擇一位敵人，並用ACT選項對敵人作出一個或多個具體的行為。
- Kris可以檢查遭遇戰中的任何敵人，以了解其名稱、ATK和DF等相關資料，以及有關該敵人的相關文字。在Lancer和Susie的戰鬥中調查Susie，除了ATK和DF以外還會另外顯示她的HP。
- 行動是和平結束戰鬥的主要方式。
- 某些行動會需要Kris和其他成員(基本上以命令其他成員居多)合體使用，這樣的行動通常比只有Kris的單獨行動效果更好。
- Kris和Ralsei可以選擇"警告"敵人小心Susie的攻擊，使得Susie的攻擊失誤。如果希望所有戰鬥都和平解決，那麼這一點十分重要。
- 敵人處於可寬恕的狀態時，它們的名字會變成黃色。
- Susie的"S-行動"和Ralsei的"R-行動"是Kris行動的變種，只有在第二章與Sweet Cap'n Cakes戰鬥過後才會出現，大部分是屬於Kris行動的延伸。
魔法(MAGIC)[]
現在你收集了TP...
讓我用TP來施展法術吧？Ralsei
這個選項只有Susie、Ralsei和Noelle可以使用。如果有足夠的TP，則隊伍成員可以使用傷害增加、治療隊伍成員或是安撫...等相關法術。
- Susie的法術有兩種：純攻擊型和終極治療。純攻擊型可以對敵人產生大量的傷害；終極治療只能恢復隊伍少許HP。
- Ralsei的法術有兩種：治療隊伍成員或是安撫疲倦的敵人。
- Noelle的法術是Susie和Ralsei的合體：治療隊伍成員、寬恕疲倦敵人的睡眠迷霧、進入冰雪之墓路線的冰震术和冰雪之墓。
道具(ITEM)[]
你那麼想學習關於道具的說明嗎，Kris…？明白了，我來教你！
唔...你使用了它們以後，就會發生什麼事情。Ralsei
使用消耗品來治癒成員或是整個小隊的HP，也或是治癒倒下的成員。有些物品在戰鬥中使用可以恢復更多HP，因此建議在這種情況下使用它們。
寬恕(SPARE)[]
如果我們寬恕所有敵人，就再也不需要戰鬥啦！
Ralsei
寬恕敵人可以將它從戰鬥中移除，使得戰鬥可以和平解決的方式結束。可以利用小隊的優勢在同一回合中行動並寬恕敵人。
- 可以寬恕的敵人，名字會是黃色的，並且旁邊出現星號。
- 嘗試對尚未達到寬恕條件的敵人寬恕，遊戲會表示目前不滿足"寬恕"條件，並且敵方會發出短暫的黃光。
- 但是大多數的敵人(像是Rudinn、Hathy和Rabbick)可以透過重複選擇寬恕選項10次或5次(Rudinn Ranger)來達到寬恕條件。這十分費時，因此行動還是最佳選擇。
- 在遊戲中的敵人可能會在某些行動或是使用物品後感到疲倦，名字會變成藍色的。這時的寬恕方法就是Ralsei的"安撫"法術。若敵人同時疲倦和達到寬恕條件，則敵人的名字會以兩種顏色漸變的形式出現。
- Undertale中"寬恕"選項是在"仁慈(MERCY)"選項裡。
- 從第二章開始，可寬恕的數值會在敵人名字旁顯示，若寬恕值為100%就可直接寬恕敵人，但某些敵人無法被寬恕(顯示[❌])，此時只能用暴力攻擊擊倒。
防禦(DEFEND)[]
選擇防禦，你受到的傷害就會減少...
不僅這樣，你還能收集TP！Ralsei
讓被選擇的成員在敵人攻擊時保護自己，可以減少傷害並在獲得16TP。防禦是收集TP的主要方法，這在施放法術中顯得十分重要。若沒有更好的選擇，並希望和平結束戰鬥，則可以優先選擇此選項。戰鬥結束後剩餘的TP會轉換為D$。
敵人的回合[]
敵人攻擊前的一些對話可以用[X]跟[Z]跳過，但是在某些情況下(像是慢速出現的對話)無法跳過。
Kris的靈魂此時會被放在彈幕面板。敵人可以攻擊面板中的靈魂，玩家則可用方向鍵控制靈魂來閃避攻擊。依據不同的戰鬥敵人，攻擊時的子彈形狀會有多種不同的形態。與複數的敵人戰鬥時，它們的攻擊會重疊在面板上。
敵方的攻擊類型大部分與Undertale中的攻擊類型類似：
- 白色攻擊在碰觸到時會單純地傷害。
- 綠色攻擊可以治癒小隊HP。
- 淺藍色攻擊可以在黃色模式下射擊摧毀。
可以在戰鬥中靠近敵人的攻擊卻不被擊中(擦彈)，讓靈魂周圍圍繞著白色心形輪廓，這可使TP增加，有些敵人甚至可以縮短攻擊時間。
戰鬥結束條件[]
遭遇戰可用以下的方式結束：
勝利[]
透過和平或暴力的方式讓所有敵人移出戰鬥。遊戲會根據敵人數量和剩餘TP來給予"黑暗幣"作為獎勵。若用暴力攻擊結束戰鬥會顯示"你變得更強了"。
戰敗[]
當小隊所有成員的HP歸零會讓遊戲結束，並且提示是否繼續遊戲：
- 選擇繼續遊戲，則會回到遭遇戰前的最後一個存檔點。
- 選擇不繼續遊戲，則會播放"Darkness Falls"，並表示"籠罩世界的黑暗將永不消散"後黑屏，並在1分鐘後自動關閉。
與Undertale不同，遊戲中缺少了逃跑(Flee)的選項，這有可能是因為在戰鬥外可以透過"奔跑"(預設[X])來躲避戰鬥。
狀態效果[]
遊戲中的敵人目前有四種狀態效果會影響戰鬥。
疲倦[]
這些敵人可以透過Ralsei的安撫法術饒恕。
疲倦狀態是由大多數行動引起的，少數敵人可以透過閱讀Ralsei的手冊達到此效果。
睡著[]
這種狀態的敵人處於睡眠狀態，因此無法行動，直到被擊敗或以其他方式醒來。與"疲倦"類似，可以透過Ralsei的安撫法術饒恕。
睡著狀態是由Kris命令Ralsei唱搖籃曲所引起的，只有Ponman和Susie會有這種效果。
被警告[]
Susie無法攻擊被警告的敵人，如果希望所有戰鬥都和平解決，那麼這一點十分重要。
警告狀態是由Kris和Ralsei透過行動中的"警告"引起的，有些敵人無法被警告(像是C. Round)。
凍結[]
被凍結的敵人會視為被擊倒，因此無法行動或與其互動。並且即使戰鬥結束後，冰凍狀態仍然存在。在冰雪之墓路線中即使在重新進入房間，凍結的敵人仍會保持凍結狀態並且不會重生。凍結狀態只能由Noelle使用"冰凍爆破"擊敗敵人時擁有。
由於一般敵人在HP耗盡時逃跑，但是在凍結時無法逃跑，因此這是完成冰雪之墓路線所必需的。